試験範囲

細胞情報論Ⅰ(月4)

アミノ酸

20種の構造、名前、性質(解離定数)

• アミノ酸：L-アミノ酸(RとHが逆ならD-アミノ酸)

NH2
Ⅰ
R-Cα-H
　 Ⅰ
COOH

※Cα=不斉炭素

• 解離定数
• 酸と塩基

RH⇆R-＋H+

• 解離定数: Ka=[R-][H+]/[RH]

logKa=log([R-]/[RH])+log[H+]
-pKa=log([R-]/[RH])-pH 　　※p=-log
∴pH=pKa+log([R-]/[RH])
※pH=pKaのとき、解離基の半分が解離している。

• タンパク質の等電点：タンパク質全体の正、負の電荷が等しくなった点
• N末端：Asp,Glu,His
• C末端：Lys,Arg

計算によって予測可能

• タンパク質の精製手法
• 分子ふるいカラム
• イオン交換カラム:タンパク質の等電点の違いにより分離する。

　　カチオン:+チャージのタンパク質が吸着
アニオン:-チャージのタンパク質が吸着

タンパク質の構造

• 構造形成
• 静電気的相互作用:[Lys,Arg]と[Glu,Asp]
• 水素結合
• 疎水的相互作用:脂肪族アミノ酸、芳香族アミノ酸のパッキング

• 1次構造:アミノ酸配列
• 2次構造:ポリペプチド鎖(βシート、αへリックス)
• 3次構造:folding
• 4次構造:複合体形成
• 構造解析手法：分子量測定、1次〜構造解析、

タンパク質の機能

• 触媒:酵素反応、阻害剤解析
• ミカエリス-メンテンの式の導出

タンパク質の相互作用

• Yeast two hybrid screening
• Phage display
• GST pull down
• Far Western
• Surface plasmon resonance
• FRET
• Fluorescence polarization

ヘモグロビン(おまけ)