wmodeをJavascript側でも指定

Flashを背面に持ってくるには、AC_FL_RunContentで以下の記載が必要

AC_FL_RunContent( 'codebase','http://download.macromedia.com/pub/shockwave/cabs/flash/swflash.cab#version=9,0,28,0','width','100','height','100','src','Hoge','quality','high','wmode','opaque','pluginspage','http://www.adobe.com/shockwave/download/download.cgi?P1_Prod_Version=ShockwaveFlash','movie','Hoge' ); //end AC code

まぁ要は

'wmode','opaque'

がないとダメってことです。

もちろん